Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim12cD3Z3L3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim12cD3Z3L3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12cD3Z3L3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms