Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
3425401B19RikD3Z1D3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
3425401B19RikD3Z1D3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
3425401B19RikD3Z1D3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms