Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm17333C6EQI3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17333C6EQI3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms