Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Apba1B2RUJ5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Apba1B2RUJ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms