Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Brpf3B2KF05 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brpf3B2KF05 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms