Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pde4bB1AWC9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pde4bB1AWC9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pde4bB1AWC9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms