Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prr29B1ARI9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prr29B1ARI9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Prr29B1ARI9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prr29B1ARI9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms