Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Odf2A3KGV1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Odf2A3KGV1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2A3KGV1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms