Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatsperbA2RTF1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms