Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef17A2ASJ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramef17A2ASJ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms