Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Patl2A2ARM1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms