Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a3A2ACT7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a3A2ACT7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col9a3A2ACT7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms