Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1I1

Igkv16-104, Immunoglobulin kappa variable 16-104 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms