Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Mbd3Q9Z2D8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd3Q9Z2D8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mbd3Q9Z2D8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms