Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X9

Cdc45, Cell division control protein 45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc45Q9Z1X9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc45Q9Z1X9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc45Q9Z1X9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc45Q9Z1X9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc45Q9Z1X9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc45Q9Z1X9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc45Q9Z1X9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdc45Q9Z1X9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc45Q9Z1X9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms