Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Shcbp1Q9Z179 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shcbp1Q9Z179 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Shcbp1Q9Z179 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms