Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1h3Q9Z0Y9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1h3Q9Z0Y9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms