Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cib1Q9Z0F4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cib1Q9Z0F4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cib1Q9Z0F4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms