Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stub1Q9WUD1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms