Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ggps1Q9WTN0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ggps1Q9WTN0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms