Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6cQ9WTM3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6cQ9WTM3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms