Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0W9

Chrna6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna6Q9R0W9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna6Q9R0W9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna6Q9R0W9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms