Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Zeb2Q9R0G7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zeb2Q9R0G7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zeb2Q9R0G7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms