Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a3Q9QZS0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col4a3Q9QZS0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.6 ms