Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a4Q9QZR9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a4Q9QZR9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms