Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Irx4Q9QY61 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx4Q9QY61 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms