Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nphp1Q9QY53 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nphp1Q9QY53 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nphp1Q9QY53 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms