Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plxnb3Q9QY40 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plxnb3Q9QY40 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms