Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nr2e3Q9QXZ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr2e3Q9QXZ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms