Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Limd1Q9QXD8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Limd1Q9QXD8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms