Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabgef1Q9JM13 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabgef1Q9JM13 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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