Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gde1Q9JL56 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gde1Q9JL56 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms