Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmx1aQ9JKU8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmx1aQ9JKU8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms