Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrQ9JKK8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AtrQ9JKK8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms