Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx20Q9JJY4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx20Q9JJY4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ddx20Q9JJY4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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