Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bgrlQ9JJU8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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