Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gfra4Q9JJT2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfra4Q9JJT2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.1 ms