Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Bco1Q9JJS6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Bco1Q9JJS6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Bco1Q9JJS6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Bco1Q9JJS6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Bco1Q9JJS6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Bco1Q9JJS6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Bco1Q9JJS6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Bco1Q9JJS6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Bco1Q9JJS6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Bco1Q9JJS6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Bco1Q9JJS6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bco1Q9JJS6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Bco1Q9JJS6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Bco1Q9JJS6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Bco1Q9JJS6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bco1Q9JJS6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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