Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scube2Q9JJS0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scube2Q9JJS0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms