Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc12a4Q9JIS8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc12a4Q9JIS8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc12a4Q9JIS8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.8 ms