Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx21Q9JIK5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx21Q9JIK5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx21Q9JIK5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx21Q9JIK5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx21Q9JIK5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx21Q9JIK5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx21Q9JIK5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx21Q9JIK5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx21Q9JIK5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx21Q9JIK5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx21Q9JIK5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx21Q9JIK5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx21Q9JIK5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx21Q9JIK5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms