Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LratQ9JI60 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LratQ9JI60 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LratQ9JI60 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms