Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF7

Hpgds, Hematopoietic prostaglandin D synthase, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpgdsQ9JHF7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpgdsQ9JHF7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpgdsQ9JHF7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HpgdsQ9JHF7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HpgdsQ9JHF7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HpgdsQ9JHF7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HpgdsQ9JHF7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HpgdsQ9JHF7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HpgdsQ9JHF7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HpgdsQ9JHF7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HpgdsQ9JHF7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HpgdsQ9JHF7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HpgdsQ9JHF7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms