Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SelenofQ9ERR7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenofQ9ERR7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms