Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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