Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx12Q9ER00 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx12Q9ER00 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Stx12Q9ER00 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms