Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ1

Mlst8, Target of rapamycin complex subunit LST8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlst8Q9DCJ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mlst8Q9DCJ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mlst8Q9DCJ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mlst8Q9DCJ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms