Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc46a3Q9DC26 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc46a3Q9DC26 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms