Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf6Q9DBU5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf6Q9DBU5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.3 ms