Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med29Q9DB91 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms